Arachis stensoperma RNASeq nematoide
A espécie silvestre A. stenosperma mostra altos níveis de resistência a uma variedade de patógenos, incluindo o nematóide das galhas (RKN) Meloidogyne arenaria. Visando identificar genes e reguladores envolvidos nessa resposta de defesa, realizamos a análise do transcriptoma das raízes de A. stesnoperma durante os primeiros estágios desta interação incompatível usando Illumina Hi-Seq. Ao todo foram produzidas oito bibliotecas de cDNA gerando 28,2 GB, que foram montadas de novo em 44.132 contigs e 37.882 loci. Genes diferencialmente expressos (DEGs) foram identificados e agrupados de acordo com seu perfil de expressão, sendo a maioria regulada negativamente aos 6 DAI, que coincide com o início da FC. Esses genes candidatos estão envolvidos nas vias dos ácidos salicílico (NBS-LRR, lipocalinas, resveratrol sintase) e jasmônico (patatina, aleno oxidase ciclase), e também relacionados ao equilíbrio hormonal (proteína responsiva à auxina, GH3) e à plasticidade e sinalização celular (tetraspanina, integrina, expansina), com alguns deles apresentando comportamento de expressão contrastante entre genótipos resistentes e suscetíveis de Arachis RKN.
